Fue creada de conformidad al Acuerdo número 001 de 1981diciembre 2, Artículo 33 y acuerdo 014 del 16 de junio de 1997, Artículo Segundo Literal C, y su parágrafo, y el reglamentario Acuerdo número 013 de 1999, abril 5, Parágrafo Primero. La Bandera esta conformada por tres franjas horizontales: Amarilla, blanca y verde. Amarilla: Colocada en la parte superior, representando las minas de oro, explotadas en la época de la colonia, ancho 40 cms. Blanco: al centro representa las minas de plata explotadas por nuestros antepasados, de 50 cms, de ancho; lleva inserto al centro el Real Escudo de Armas. Verde: en la parte inferior, representa la fertilidad de nuestras tierras en dimensión de 40 cms de ancho. La Bandera mide 1,30 mts de ancho por 2mts de largo. Fuera del arte de la Bandera, lleva la inscripción, “Bandera de San Sebastián de Mariquita”. Guillermo Giraldo Gutiérrez, Coordinador de Cultura y Turismo.

Colores usados: Y, W, V